女性阴道内有小疙瘩的原因很多，有可能是内分泌的原因造成的，也有可能是如您说的囊肿，所以您现在要做的就是到医院来做相关检查，检查一下是什么原因造成的，有可能只是炎症造成的，简单的治疗即可，如果是囊肿则需要化验一下是良性还是恶性，以便及时的治疗。是否需要手术还需要通过检查后才清楚。(指导阅读：女性预防阴道恶性病变如何做)